Origem e contexto
Após a aposentadoria de Kenshin Himura como retalhador, Makoto Shishio assumiu o posto de assassino das sombras a serviço dos monarquistas (Ishin Shishi). Sua primeira grande missão foi eliminar Izuka, o traidor do grupo. Devido à natureza implacável de suas ações, o futuro governo Meiji manteve a existência de Shishio sob absoluto sigilo, limitando as informações sobre ele até mesmo entre aliados.
Trajetória na franquia
Temendo a ambição desmedida de Shishio, o governo Meiji tentou executá-lo durante a Guerra Boshin. Ele foi baleado na cabeça, banhado em óleo e queimado vivo, mas sobreviveu ao atentado com sequelas graves que exigiram o uso constante de faixas. Consumido pelo desejo de vingança, ele fundou o Juppongatana, um grupo de elite com os dez melhores combatentes do Japão, focado em derrubar a nova era Meiji.
Filosofia e legado
Shishio baseia suas ações na lei da sobrevivência, onde os fortes devoram os fracos. Sob essa premissa de darwinismo social, ele moldou a personalidade de Seta Sojiro, seu braço direito e principal guerreiro. O objetivo do vilão era industrializar o Japão por meio do petróleo e estabelecer um regime sob seu comando direto.